La cartographie des pathologies et des dépenses s’appuie, depuis 2010, sur les données issues du Sniiram (Système national d'information interrégimes de l'Assurance maladie), dont le PMSI (Programme de médicalisation des systèmes d'Information). Elle concerne environ 57 millions de bénéficiaires du régime général (sections locales mutualistes comprises) ayant eu recours à des soins remboursés dans l’année. Des algorithmes permettent de repérer les patients ayant une pathologie chronique, un traitement chronique ou un événement de santé, à partir des diagnostics mentionnés dans le PMSI à la suite d'une hospitalisation, ou du diagnostic ayant donné lieu à une prise en charge pour Affection de longue durée (ALD), ou d'actes ou médicaments spécifiques de pathologies, donc à partir d’un recours à des soins spécifiques et remboursés.
Treize grands groupes de pathologies ont été créés, correspondant à 56 groupes non exclusifs de pathologies. Par exemple, une personne souffrant d’un cancer et d’une affection psychiatrique fera partie des deux groupes de personnes atteintes par les pathologies correspondantes.
Les effectifs et les taux de patients sont déclinables par classes d’âge, de sexe, régions et départements de résidence, pour les assurés du régime général d’Assurance maladie.
La cartographie des dépenses liées à ces pathologies permet quant à elle de répartir les dépenses remboursées par l'Assurance Maladie et chaînables à chaque patient en fonction des pathologies chroniques, des traitements chroniques et des événements de santé (près de 134 milliards d'euros pour le régime général de l'Assurance Maladie et plus de 158 milliards d’euros par extrapolation pour l'ensemble des régimes).
Ces dépenses attribuables aux pathologies chroniques, traitements chroniques et événements de santé sont données au niveau national, pour le régime général et tous régimes d’Assurance maladie confondus. La méthodologie d’affectation de ces dépenses ne permet pas de réaliser de déclinaison géographique.
